Fiche 86. Les facteurs de transcription

Les facteurs de transcription sont des protéines ayant la capacité de se fixer sur des séquences spécifiques de l’ADN. L’analyse de plusieurs facteurs de transcription chez différentes espèces montre que beaucoup de ces facteurs sont organisés en domaines fonctionnels : le domaine de liaison à l’ADN, le domaine d’activation de la transcription et, dans de nombreux cas, un domaine de liaison à un ligand.
Les facteurs de transcription eucaryotes se lient à l’ADN grâce à des domaines présentant des structures tridimensionnelles bien définies. Cependant, en dépit de différences structurales importantes, les différentes classes de facteurs de transcription utilisent fréquemment une hélice α comme motif protéique de reconnaissance de l’ADN.Hélice-tour-hélice (HTH). Le domaine hélice-tour-hélice est constitué de deux hélices α constituées de 8-10 acides aminés chacune, séparées par trois acides aminés formant un coude. L’hélice en position C-terminale, dite de reconnaissance, s’ajuste dans le grand sillon de l’ADN et interagit spécifiquement avec certaines bases du site de liaison tandis que l’hélice N-terminale de soutien interagit avec le squelette sucre-phosphate du petit sillon (figure 1).Hélice-boucle-hélice (bHLH). Le domaine hélice-boucle-hélice est composé d’une hélice α N-terminale contenant des résidus basiques séparée d’une courte hélice α amphiphatique C-terminale par une région formant une boucle de longueur variable. L’hélice amphiphatique C-terminale sert à la dimérisation tandis que l’hélice basique interagit avec les bases du grand sillon (figure 2A)…