Notes

• [1]
  Paul Veyne, Comment on écrit l’histoire. Essai d’épistémologie, Seuil, Paris, 1971.
• [2]
  George Gaylard Simpson, This View of Life : The World of an Evolutionist, Harcourt, Brace and World Inc., New York, 1964.
• [3]
  Sur les différents usages de la notion de hasard dans la théorie de l’évolution, voir Jean Gayon, « Le hasard dans la théorie évolutionniste moderne : une analyse philosophique », Bull. Hist. Epistém. Sci. Vie, n^o 1, 1994, p. 4-15.
• [4]
  F. John Odling-Smee, Kevin N. Laland et Marcus W. Feldman, Niche Construction. The Neglected Process in Evolution, Princeton University Press, Princeton, 2003.
• [5]
  D’Arcy Thompson, On Growth and Form, Cambridge University Press, Cambridge, 1917 ; trad. Forme et croissance, Seuil, Paris, 1994.
• [6]
  John von Neumann et Oskar Morgenstern, Theory of Games and Economic Behavior : Sixtieth-anniversary Edition, Princeton University Press, Princeton, 2004 ; John Maynard Smith, Evolution and the Theory of Games, Cambridge University Press, Cambridge, 1982.
• [7]
  Richard Dawkins, The Selfish Gene, Oxford University Press, New York, 1976 ; trad. française Le Gène égoïste, Mengès, Paris, 1978.
• [8]
  Robert Heinsohn et Sarah Legge, « The cost of helping », TREE, n^o 14, 1999, p. 53-57.
• [9]
  John Maynard Smith et David Harper, Animal Signals, Oxford University Press, Oxford, 2003.
• [10]
  E. A. Herre, N.  Knowlton, U. G. Mueller et S. A. Rehner, « The evolution of mutualisms : exploring the paths between conflict and cooperation », TREE, n^o 14, 1999, p. 49-53.
• [11]
  M. Van Baalen et V. A. A. Jansen, « Dangerous liaisons : the ecology of private interest and common good », Oikos, n^o 95, 2001, p. 211-224.
• [12]
  « Trade-off » en anglais.
• [13]
  Carl Zimmer, « Stretching the limits of evolutionary biology », Science, n^o 304, 2004, p. 1235-1236.
• [14]
  D. Haig, « Genomic imprinting and kinship : how good is the evidence ? », Annu. Rev. Genet., n^o 38, 2004, p. 553-585.
• [15]
  Critiqué in Clive D. L. Wynne, « The perils of anthropomorphism », Nature, n^o 428, 2004, p. 606.
• [16]
  Francis L. W. Ratnieks et P. Kirk Visscher, « Worker policing in the honeybee », Nature, n^o 342, 1989, p. 796-797.
• [17]
  Christian W. W. Pirk, Peter Neumann, Randall Hepburn, Robin F. A. Moritz et Jürgen Tautz, « Egg viability and worker policing in honey bees », Proc. Natl. Acad. Sci. USA, n^o 101, 2004, p. 8649-8651.
• [18]
  Rolf F. Hoekstra, « Why sex is good », Nature, n^o 434, 2005, p. 571-573.
• [19]
  Stephen C. Stearns, The Evolution of Life Histories, Oxford University Press, Oxford, 1992.
• [20]
  Ian Woodward, « Tall storeys », Nature, n^o 428, 2004, p. 807-808.
• [21]
  Denis Duboule et Adam S. Wilkins, « The evolution of “bricolage” », TIG, n^o 14, 1998, p. 54-59.
• [22]
  Michel Morange, « Remettre un peu d’ordre physicochimique dans l’exubérance fonctionnelle du vivant », Médecine/Sciences, n^o 19, 2003, p. 1-2.
• [23]
  Wesley C. Salmon, Causality and explanation, op. cit.
• [24]
  Andrew B. Clifford et Lawrence M. Witmer, « Case studies in novel narial anatomy : 2. The enigmatic nose of moose (Artiodactyla : Cervidae : Alces alces) », J. Zool., n^o 262, 2004, p. 339-360.
• [25]
  Lawrence M. Witmer, « A nose for all reasons », Nat. Hist., n^o 110, 2001, p. 64-71.
• [26]
  Stephen J. Gould et Richard Lewontin, « The spandrels of San Marco and the panglossian paradigm : A critique of the adaptationist programme », Proc. Roy. Soc. London B, n^o 205, 1979, p. 581-598.
• [27]
  Ernst Mayr, « 80 years of watching the evolutionary scenery », Science, n^o 305, 2004, p. 46-47.
• [28]
  Stephen Jay Gould, Wonderful Life, W. W. Norton & Co., New York, 1989 ; trad. française : La Vie est belle, Seuil, Paris, 1991.
• [29]
  Jonathan M. W. Slack, P. W. H. Holland et C. F. Graham, « The zootype and the phylotypic stage », Nature, n^o 361, 1993, p. 490-492.
• [30]
  Andrew H. Knoll et Sean B. Carroll, « Early animal evolution : emerging views from comparative biology and geology », Science, n^o 284, 1999, p. 2129-2137.
• [31]
  Ping Wu, Ting-Xin Jiang, Sanong Suksaweang, Randall Bruce Widelitz et Cheng-Ming Chuong, « Molecular shaping of the beak », Science, n^o 305, 2004, p. 1465-1466.
• [32]
  Arhat Abzhanov, Meredith Protas, B. Rosemary Grant, Peter R. Grant et Clifford J. Tabin, « Bmp4 and morphological variation of beaks in Darwin’s finches », Science, n^o 305, 2004, p. 1462-1465.
• [33]
  Nicholas I. Mundy, Nichola S. Badcock, Tom Hart, Kim Scribner, Kirstin Janssen et Nicola J. Nadeau, « Conserved genetic basis of a quantitative plumage trait involved in mate choice », Science, n^o 303, 2004, 1870-1873.
• [34]
  Michael W. Nachman, Hopi E. Hoekstra et Susan L. D’Agostino, « The genetic basis of adaptive melanism in pocket mice », Proc. Natl. Acad. Sci. USA, n^o 100, 2003, p. 5268-5273.
• [35]
  Mihael D. Shapiro, Melissa E. Marks, Catherine L. Peichel, Benjamin K. Blackman, Kirsten S. Nereng, Bjarni Jonsson et al., « Genetic and developmental basis of evolutionary pelvic reduction in threespine sticklebacks », Nature, n^o 428, 2004, p. 717-723.
• [36]
  Yoshiyuki Yamamoto, David W. Stock et William R. Jeffery, « Hedgehog signalling controls eye degeneration in blind cavefish », Nature, nº 431, 2004, p. 844-847.
• [37]
  De même, dans le domaine végétal, les mêmes mécanismes moléculaires auraient été recrutés plusieurs fois au cours de l’évolution, de manière indépendante, pour la formation des feuilles : C. Jill Harrison, Susie B. Corley, Elizabeth C. Moylan, Debbie L. Alexander, Robert W. Scotland et Jane A. Langdale, « Independent recruitment of a conserved developmental mechanism during leaf evolution », Nature, n^o 434, 2005, p. 509-514.
• [38]
  Thomas D. Kocher, « Adaptive evolution and explosive speciation : the cichlid fish model », Nature Reviews/Genetics, n^o 5, 2004, p. 288-298.
• [39]
  Jerry A. Coyne, H. Allen Orr, Speciation, Sinauer, Sunderland Mass., 2004.
• [40]
  James M. Cheverud, « Quantitative genetics and developmental constraints on evolution by selection », J. Theor. Biol., n^o 110, 1984, p. 155-171 ; Stevan J. Arnold, « Constraints on phenotypic evolution », Am. Nat., n^o 140, 1992, p. S85-S107.
• [41]
  Alan Turing, « The chemical basis of morphogenesis », Phil. Trans. Roy. Soc. London ser. B, n^o 237, 1952, p. 37-72.
• [42]
  Isaac Salazar-Ciudad, Jordi Garcia-Fernandez et Ricard V. Solé, « Gene networks capable of pattern formation : from induction to reaction-diffusion », J. Theoret. Biol., n^o 205, 2000, p. 587-603 ; I. Salazar-Ciudad, S. A. Newman et R. V. Solé, « Phenotypic and dynamical transitions in model genetic networks I. Emergence of patterns and genotype-phenotype relationships », Evolution & Development, n^o 3, 2001, p. 84-94 ; I. Salazar-Ciudad, R. V. Solé et S. A. Newman, « Phenotypic and dynamical transitions in model genetic networks II. Application to the evolution of segmentation mechanisms », Evolution & Development, n^o 3, 2001, p. 95-103.