Chapitre XI. Les roches organiques

Même dans les milieux où la production primaire de matière organique est élevée, sa conservation dans les sédiments et son insertion dans le cycle géologique est problématique. Si l’on prend l’exemple de l’océan, la matière organique produite par le phytoplancton dans la zone photique est en grande partie recyclée dans la chaîne alimentaire. Une partie réduite de cette matière organique tombe à travers la colonne d’eau vers le fond marin en subissant encore des processus de décomposition et enfin, dans le sédiment, une part importante de la matière organique est détruite par oxydation dans la tranche bioturbée (Fig. XI.1).
On considère qu’il y a en général un rapport de 1 à 100 entre production primaire et matière organique arrivant sur le fond marin.La dégradation aérobie de la matière organique correspond schématiquement à la réaction suivante:
C6H12O6 + 6 O2 → 6 CO2 + 6 H2O
C’est la réaction inverse du processus mis en oeuvre dans la production primaire de sucre par la photosynthèse. Dans les sédiments bioturbés où l’oxygène peut pénétrer, la matière organique est oxydée. Dans les milieux déficitaires en O2, la décomposition de la matière organique est incomplète et certains composés relativement stables peuvent être préservés.
Les conditions menant à une diagenèse précoce anaérobie sont:
une production de matière organique tellement importante que sa dégradation consomme tout l’oxygène disponible; c’est le cas de certaines zones océaniques à haute productivité …