Parler de la diversité des plantes, c’est évoquer 250 000 espèces très diverses, depuis les plantes arborescentes, de taille parfois impressionnante, comme les grands séquoias, aux herbacées à fleurs minuscules, comme les fleurs de Lemna ou, au contraire, de taille étonnante comme les fleurs de Rafflesia qui peuvent atteindre 1 kg.
L’objectif de la taxonomie végétale est de rendre cette diversité intelligible par le moyen d’une classification. Celle-ci se fonde sur la phylogénie végétale, c’est-à-dire sur la reconstruction de l’histoire évolutive des plantes. Discipline récente (elle a moins de dix ans), la phylogénie moléculaire s’inscrit dans la continuité de la taxonomie des plantes — ou botanique —, qui représentent, quant à elles, l’aboutissement de plusieurs siècles de travaux.
L’exposé sera divisé en cinq parties.
La première, après un historique sur la botanique traditionnelle, présente quelques principes de la taxonomie.
La deuxième partie aborde la taxonomie moléculaire et les apports de cette approche dans différents domaines : discussion sur les critères de classification, origine des plantes à fleur concernant les critères de classification classique, et l’origine des plantes à fleur par rapport aux travaux antérieurs.
La troisième partie a pour but d’expliquer certains mécanismes de l’évolution, essentiellement l’hybridation. La coévolution plantes-insectes représente un autre mode de spéciation, qui sera également illustré.
Une quatrième partie montre les limites de la phylogénie moléculaire…